Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SKOR1P84550 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SKOR1P84550 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms