Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX5P78411 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX5P78411 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX5P78411 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX5P78411 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX5P78411 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX5P78411 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX5P78411 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX5P78411 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX5P78411 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX5P78411 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX5P78411 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX5P78411 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX5P78411 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX5P78411 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX5P78411 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX5P78411 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX5P78411 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX5P78411 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX5P78411 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX5P78411 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX5P78411 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX5P78411 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX5P78411 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX5P78411 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX5P78411 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX5P78411 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX5P78411 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX5P78411 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX5P78411 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX5P78411 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX5P78411 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX5P78411 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX5P78411 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX5P78411 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX5P78411 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX5P78411 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX5P78411 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX5P78411 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX5P78411 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX5P78411 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX5P78411 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX5P78411 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX5P78411 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX5P78411 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX5P78411 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms