Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOMO3P69849 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NOMO3P69849 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms