Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RBX1P62877 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RBX1P62877 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RBX1P62877 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RBX1P62877 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RBX1P62877 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBX1P62877 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBX1P62877 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBX1P62877 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBX1P62877 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBX1P62877 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBX1P62877 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBX1P62877 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBX1P62877 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBX1P62877 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBX1P62877 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
RBX1P62877 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
RBX1P62877 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms