Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ARF6P62330 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ARF6P62330 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF6P62330 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF6P62330 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF6P62330 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARF6P62330 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms