Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
COPZ1P61923 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
COPZ1P61923 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms