Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ROMO1P60602 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms