Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GSDMDP57764 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GSDMDP57764 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms