Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
UBASH3AP57075 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms