Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
AFDNP55196 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFDNP55196 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFDNP55196 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFDNP55196 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFDNP55196 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
AFDNP55196 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFDNP55196 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFDNP55196 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFDNP55196 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFDNP55196 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFDNP55196 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFDNP55196 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFDNP55196 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFDNP55196 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFDNP55196 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFDNP55196 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFDNP55196 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFDNP55196 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFDNP55196 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFDNP55196 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
AFDNP55196 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFDNP55196 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFDNP55196 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFDNP55196 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFDNP55196 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFDNP55196 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
AFDNP55196 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFDNP55196 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFDNP55196 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFDNP55196 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFDNP55196 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFDNP55196 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFDNP55196 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFDNP55196 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFDNP55196 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFDNP55196 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFDNP55196 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFDNP55196 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
AFDNP55196 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
AFDNP55196 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
AFDNP55196 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
AFDNP55196 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
AFDNP55196 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFDNP55196 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFDNP55196 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFDNP55196 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFDNP55196 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFDNP55196 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFDNP55196 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFDNP55196 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFDNP55196 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFDNP55196 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFDNP55196 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFDNP55196 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFDNP55196 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFDNP55196 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFDNP55196 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFDNP55196 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFDNP55196 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFDNP55196 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFDNP55196 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFDNP55196 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFDNP55196 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFDNP55196 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
AFDNP55196 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFDNP55196 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFDNP55196 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFDNP55196 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms