Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LUMP51884 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LUMP51884 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LUMP51884 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LUMP51884 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LUMP51884 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LUMP51884 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LUMP51884 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LUMP51884 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms