Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLCN6P51797 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLCN6P51797 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms