Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GSK3BP49841 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GSK3BP49841 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms