Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POU3F4P49335 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
POU3F4P49335 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms