Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC10P48553 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAPPC10P48553 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms