Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSSP48449 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSSP48449 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSSP48449 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSSP48449 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSSP48449 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSSP48449 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSSP48449 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LSSP48449 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LSSP48449 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LSSP48449 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LSSP48449 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSSP48449 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSSP48449 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSSP48449 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSSP48449 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSSP48449 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSSP48449 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSSP48449 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSSP48449 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSSP48449 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LSSP48449 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LSSP48449 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LSSP48449 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LSSP48449 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LSSP48449 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms