Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NEDD4P46934 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEDD4P46934 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEDD4P46934 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms