Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKI67P46013 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MKI67P46013 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
MKI67P46013 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.52■■□□□ 1.51
MKI67P46013 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MKI67P46013 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MKI67P46013 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MKI67P46013 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKI67P46013 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKI67P46013 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKI67P46013 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MKI67P46013 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MKI67P46013 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MKI67P46013 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKI67P46013 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKI67P46013 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKI67P46013 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MKI67P46013 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKI67P46013 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKI67P46013 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKI67P46013 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MKI67P46013 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MKI67P46013 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms