Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NKX2-1P43699 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NKX2-1P43699 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms