Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTGER2P43116 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTGER2P43116 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PTGER2P43116 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PTGER2P43116 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms