Protein–RNA interactions for Protein: P37023

ACVRL1, Serine/threonine-protein kinase receptor R3, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVRL1P37023 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACVRL1P37023 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACVRL1P37023 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms