Protein–RNA interactions for Protein: P35711

SOX5, Transcription factor SOX-5, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX5P35711 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX5P35711 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX5P35711 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX5P35711 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SOX5P35711 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOX5P35711 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX5P35711 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX5P35711 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX5P35711 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX5P35711 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOX5P35711 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX5P35711 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX5P35711 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX5P35711 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX5P35711 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX5P35711 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX5P35711 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX5P35711 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX5P35711 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX5P35711 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOX5P35711 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOX5P35711 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX5P35711 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX5P35711 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX5P35711 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX5P35711 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX5P35711 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX5P35711 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX5P35711 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX5P35711 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX5P35711 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOX5P35711 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX5P35711 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX5P35711 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX5P35711 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX5P35711 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX5P35711 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX5P35711 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX5P35711 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX5P35711 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SOX5P35711 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX5P35711 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX5P35711 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX5P35711 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX5P35711 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX5P35711 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX5P35711 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX5P35711 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX5P35711 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX5P35711 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOX5P35711 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SOX5P35711 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX5P35711 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX5P35711 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX5P35711 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SOX5P35711 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms