Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC1P35251 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC1P35251 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC1P35251 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC1P35251 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RFC1P35251 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC1P35251 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC1P35251 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC1P35251 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC1P35251 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC1P35251 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC1P35251 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC1P35251 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC1P35251 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC1P35251 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC1P35251 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC1P35251 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC1P35251 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC1P35251 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms