Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRHRP34981 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRHRP34981 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRHRP34981 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRHRP34981 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRHRP34981 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRHRP34981 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRHRP34981 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRHRP34981 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRHRP34981 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRHRP34981 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRHRP34981 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRHRP34981 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRHRP34981 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRHRP34981 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRHRP34981 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRHRP34981 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRHRP34981 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRHRP34981 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRHRP34981 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRHRP34981 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRHRP34981 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRHRP34981 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRHRP34981 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRHRP34981 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms