Protein–RNA interactions for Protein: P33241

LSP1, Lymphocyte-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSP1P33241 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSP1P33241 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSP1P33241 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSP1P33241 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSP1P33241 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSP1P33241 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSP1P33241 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSP1P33241 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSP1P33241 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSP1P33241 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSP1P33241 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSP1P33241 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSP1P33241 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSP1P33241 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSP1P33241 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSP1P33241 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSP1P33241 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSP1P33241 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSP1P33241 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSP1P33241 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSP1P33241 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSP1P33241 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSP1P33241 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSP1P33241 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSP1P33241 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSP1P33241 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSP1P33241 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSP1P33241 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSP1P33241 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSP1P33241 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSP1P33241 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSP1P33241 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSP1P33241 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSP1P33241 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSP1P33241 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LSP1P33241 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSP1P33241 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSP1P33241 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSP1P33241 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSP1P33241 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSP1P33241 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSP1P33241 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSP1P33241 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSP1P33241 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LSP1P33241 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LSP1P33241 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LSP1P33241 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSP1P33241 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LSP1P33241 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms