Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG3P32926 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DSG3P32926 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DSG3P32926 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG3P32926 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG3P32926 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG3P32926 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG3P32926 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG3P32926 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG3P32926 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG3P32926 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG3P32926 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG3P32926 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG3P32926 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DSG3P32926 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG3P32926 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG3P32926 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG3P32926 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG3P32926 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG3P32926 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG3P32926 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG3P32926 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG3P32926 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG3P32926 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG3P32926 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DSG3P32926 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG3P32926 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG3P32926 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG3P32926 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG3P32926 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG3P32926 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG3P32926 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG3P32926 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG3P32926 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DSG3P32926 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG3P32926 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG3P32926 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG3P32926 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG3P32926 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG3P32926 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG3P32926 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG3P32926 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG3P32926 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DSG3P32926 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG3P32926 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG3P32926 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG3P32926 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG3P32926 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG3P32926 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG3P32926 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG3P32926 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG3P32926 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG3P32926 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DSG3P32926 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
DSG3P32926 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DSG3P32926 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG3P32926 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG3P32926 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG3P32926 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG3P32926 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG3P32926 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG3P32926 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG3P32926 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG3P32926 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DSG3P32926 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DSG3P32926 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG3P32926 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG3P32926 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG3P32926 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG3P32926 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG3P32926 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG3P32926 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG3P32926 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DSG3P32926 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms