Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CASQ1P31415 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CASQ1P31415 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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