Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXC8P31273 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms