Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCSK1P29120 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCSK1P29120 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms