Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD1P28340 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD1P28340 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD1P28340 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLD1P28340 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLD1P28340 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD1P28340 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD1P28340 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD1P28340 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD1P28340 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD1P28340 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD1P28340 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLD1P28340 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD1P28340 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD1P28340 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD1P28340 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD1P28340 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD1P28340 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD1P28340 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD1P28340 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD1P28340 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLD1P28340 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLD1P28340 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLD1P28340 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLD1P28340 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLD1P28340 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLD1P28340 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLD1P28340 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLD1P28340 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
POLD1P28340 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
POLD1P28340 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
POLD1P28340 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
POLD1P28340 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
POLD1P28340 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.57■■■□□ 2
POLD1P28340 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLD1P28340 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD1P28340 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLD1P28340 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD1P28340 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
POLD1P28340 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD1P28340 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLD1P28340 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
POLD1P28340 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
POLD1P28340 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLD1P28340 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
POLD1P28340 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLD1P28340 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POLD1P28340 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POLD1P28340 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POLD1P28340 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.55■■■□□ 2
POLD1P28340 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLD1P28340 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLD1P28340 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLD1P28340 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
POLD1P28340 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
POLD1P28340 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
POLD1P28340 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLD1P28340 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLD1P28340 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLD1P28340 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLD1P28340 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
POLD1P28340 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLD1P28340 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLD1P28340 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
POLD1P28340 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLD1P28340 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLD1P28340 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
POLD1P28340 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLD1P28340 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
POLD1P28340 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
POLD1P28340 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD1P28340 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD1P28340 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLD1P28340 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms