Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PLNP26678 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PLNP26678 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PLNP26678 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PLNP26678 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLNP26678 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLNP26678 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLNP26678 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLNP26678 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLNP26678 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLNP26678 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms