Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ITGA3P26006 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ITGA3P26006 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ITGA3P26006 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms