Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM3P25205 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM3P25205 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM3P25205 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM3P25205 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM3P25205 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM3P25205 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM3P25205 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM3P25205 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM3P25205 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM3P25205 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM3P25205 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM3P25205 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM3P25205 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM3P25205 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM3P25205 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM3P25205 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM3P25205 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM3P25205 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MCM3P25205 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM3P25205 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM3P25205 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM3P25205 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM3P25205 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM3P25205 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM3P25205 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM3P25205 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCM3P25205 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3P25205 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3P25205 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3P25205 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3P25205 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3P25205 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3P25205 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCM3P25205 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCM3P25205 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCM3P25205 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms