Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRKCHP24723 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRKCHP24723 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
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