Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SP100P23497 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SP100P23497 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SP100P23497 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP100P23497 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP100P23497 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP100P23497 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SP100P23497 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SP100P23497 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP100P23497 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP100P23497 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP100P23497 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SP100P23497 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP100P23497 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP100P23497 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SP100P23497 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP100P23497 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP100P23497 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP100P23497 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SP100P23497 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SP100P23497 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP100P23497 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP100P23497 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP100P23497 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP100P23497 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP100P23497 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SP100P23497 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP100P23497 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP100P23497 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SP100P23497 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SP100P23497 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms