Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRZ1P23471 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRZ1P23471 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms