Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FGFR3P22607 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGFR3P22607 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms