Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCNA5P22460 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCNA5P22460 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms