Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EPHA1P21709 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EPHA1P21709 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 665.9 ms