Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VCAM1P19320 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VCAM1P19320 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 566.3 ms