Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG1P18858 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG1P18858 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG1P18858 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG1P18858 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG1P18858 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIG1P18858 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIG1P18858 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIG1P18858 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIG1P18858 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIG1P18858 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIG1P18858 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIG1P18858 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LIG1P18858 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIG1P18858 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIG1P18858 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIG1P18858 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIG1P18858 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LIG1P18858 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIG1P18858 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LIG1P18858 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIG1P18858 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIG1P18858 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIG1P18858 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIG1P18858 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIG1P18858 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIG1P18858 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIG1P18858 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIG1P18858 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIG1P18858 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIG1P18858 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LIG1P18858 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIG1P18858 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIG1P18858 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIG1P18858 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIG1P18858 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIG1P18858 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIG1P18858 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIG1P18858 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIG1P18858 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIG1P18858 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LIG1P18858 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIG1P18858 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIG1P18858 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIG1P18858 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIG1P18858 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LIG1P18858 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIG1P18858 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIG1P18858 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LIG1P18858 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms