Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERCC2P18074 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERCC2P18074 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms