Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOXB4P17483 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HOXB4P17483 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms