Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATP2A2P16615 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP2A2P16615 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP2A2P16615 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms