Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF2P15336 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF2P15336 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF2P15336 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF2P15336 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF2P15336 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF2P15336 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF2P15336 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF2P15336 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATF2P15336 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF2P15336 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF2P15336 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF2P15336 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATF2P15336 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF2P15336 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF2P15336 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF2P15336 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF2P15336 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF2P15336 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF2P15336 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF2P15336 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATF2P15336 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATF2P15336 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF2P15336 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF2P15336 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF2P15336 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATF2P15336 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF2P15336 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF2P15336 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF2P15336 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF2P15336 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF2P15336 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF2P15336 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATF2P15336 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF2P15336 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF2P15336 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF2P15336 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF2P15336 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF2P15336 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF2P15336 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF2P15336 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATF2P15336 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATF2P15336 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATF2P15336 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms