Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRKCSHP14314 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRKCSHP14314 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms