Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNT1P13805 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNNT1P13805 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms