Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ITGA4P13612 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ITGA4P13612 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ITGA4P13612 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms