Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACTN1P12814 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ACTN1P12814 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms