Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
VPREB1P12018 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
VPREB1P12018 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms